科学家测出杨树基因组草图
科学家首次测序了一种名为黑三角叶杨的树的基因组,使他们能够开始寻找哪些遗传密码形成了长活的、木质植物,而不是像拟南芥那样的开花植物。树在一个地点生活几十年甚至上百年,周围的环境不断地变化,它们一定有非凡的生存战略。Gerald Tuskan 和他的合作者指出,树覆盖了地球陆地表面的30%,它们必须制造木制材料,在长距离上协调信号和营养,经历季节变化和其它气候周期而存活。树的基因组将为它们如何完成这些高招提供线索。Tuskan和他的国际小组用了散弹法和序列组装,将基因组分成片段,测序这些片断,然后靠比较端部的序列将它们组装起来。他们将这个方法与遗传图谱结合起来,遗传图谱是指标明了遗传标记位置的大致基因组,组装出 Populus trichocarpa 的基因组草图。结果显示,该树经历了两个整个基因组复制事件,其中一个发生的时间与拟南芥中发生的同时。文章作者报告说,这个杨树的基因组看起来必拟南芥的基因组进化得慢。与拟南芥相比,杨树有抵抗疾病、分生组织(根和幼芽)发育、代谢输运、以及合成植物细胞壁的纤维素和木质素的扩展的基因库。
Populus trichocarpa
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